Pour chaque zone, la terre déblayée lors des fouilles est également lavée et tamisée dans l’eau du Verdouble, en contrebas de la grotte. Une fois sèche, elle est triée et les petits objets invisibles à la fouille apparaissent : fragments osseux, débris d’outils, restes de petits animaux (rongeurs, reptiles, batraciens) ou d’autres éléments, propres à la Caune de l’Arago, indicateurs de l’origine des apports sédimentaires et dans une certaine mesure des conditions paléoclimatiques. Ces objets sont collectés, classés, puis étudiés.