Initié en juillet 2001 dans les locaux d’une institution scolaire malouine, le principe d'une journée Portes Ouvertes a été reconduit lors de chaque campagne de fouille. Le plus souvent organisées au cœur de l'École Nationale de Police de Saint-Malo-Rocabey, ces manifestations ont permis au grand public de rencontrer l'équipe de fouille directement au sein de ses espaces de travail. Un parcours de découverte, renouvelé chaque année, lui était ainsi proposé : visite du laboratoire d’inventaire et de traitement du mobilier archéologique, exposition d'objets, dont un certain nombre présenté en aquarium, panneaux d'information, films et diaporamas réalisés par l’équipe de fouille... L'ensemble des fouilleurs était à chaque fois mobilisé pour guider les visiteurs et répondre à leurs questions. 

Interdit au mouillage et à la plongée, le site sous-marin des épaves a été ponctuellement ouvert au public lors des saisons de fouille puisque les plongeurs locaux ont été régulièrement conviés à venir au cours du chantier découvrir les épaves de la Natière. À leur arrivée sur zone auprès du navire support des fouilles, les plongeurs sportifs étaient accueillis par un membre de l’équipe afin d’être informés du travail archéologique et du déroulement du chantier. Une fois munis d’un plan plastifié et étanche du site, pour faciliter leur repérage sur les épaves, ils étaient autorisés à visiter le site sous-marin et à découvrir le travail des fouilleurs.